Het meetnet is opgebouwd uit een selectie van ruim 400 kilometerhokken langs deze rijkswateren. Het meetnet beperkt zich tot de flora van de oeverzone: het gebied tussen het zomerbed en de kruin van de winterdijk. De oeverzone van de geselecteerde kilometerhokken wordt iedere vier jaar geïnventariseerd op alle voorkomende plantensoorten. Van een selectie van soorten wordt naast de presentie ook de abundantie opgenomen en van lokaal voorkomende Rode-lijstsoorten wordt de verspreiding gedetailleerd vastgelegd. Tot 2012 is het meetnet in de volle hier beschreven omvang uitgevoerd door medewerkers van FLORON.

Vanaf 2012 heeft Kees Groen (Rivieren in Beweging) als vrijwilliger de meetpunten langs Rijntakken en Maas opnieuw opgenomen, deels met een lagere frequentie. Hij heeft daarbij dezelfde selectie van kilometerhokken en dezelfde inventarisatiemethode aangehouden.